動物藥學專業畢業生畢業后可以到藥品生產、檢驗、銷售、研究開發等制藥企業、保健公司、藥檢局、防疫站、現代養殖場、科研院所、行政管理部門，從事與藥學有關的藥品配方與生產、推廣與開發、經營與管理、教學與科研等工作。還可以自主研發動物藥品，申請專利，獨立建場，獨立創業。本專業畢業生還可以繼續攻讀基礎獸醫學學科的藥理學與毒理學方向碩士學位。
當今世界飛速發展，使得動物醫學的研究范圍已不再囿于畜牧業，而是像藤蔓植物一樣伸張到了公共衛生事業、社會預防醫學、伴侶動物及觀賞動物醫療保健及食品衛生、環境保護、醫藥工業等諸多領域.特別是寵物健康護理員這個新興職業的出現，更多地引起人們對動物醫學專業的好奇和關注。